Estudiantes de Doctorado

Andrea Ríos Navarro, MSc, Candidata PhD

Andrea es bióloga egresada de la Universidad del Tolima, M.Sc. en Investigación Biomédica de la Universidad de Lleida (España). Actualmente estudiante de Doctorado en Ciencias Biológicas de la Universidad de los Andes. Durante su doctorado tiene como objetivo responder desde una aproximación metabolómica y transcriptómica la pregunta: ¿Cuál es el efecto del metabolismo de Malassezia (consumo de lípidos y producción de compuestos volátiles) sobre su interacción con el hospedero y con otros organismos? Esta pregunta se responderá a través de un modelo in vitro de queratinocitos, el estudio del transcriptoma mediante RNA-seq en y el estudio del volatiloma y su efecto sobre insectos y otros miembros de la microbiota de la piel, que pueden afectar al hospedero.

Este trabajo se viene adelantando en colaboración con el grupo de investigación Laboratory of Advanced Analytical Techniques in Natural Products (LATNAP), dirigido por la porfesora Chiara Charazzone y el Laboratorio de Ciencias Básicas de la Facultad de Medicina, dirigido por el Dr. John Mario González.

Tesis: Traveling through the transcriptome and volatilome to understanding Malassezia-host-bacteria interactions

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Líneas de investigación:

  • Interacciones microbianas
  • Interacción hospedero-patógeno
  • Estudios metabólicos

Valeri Andrea saenz Moncaleano M.D. MSc, Candidata PhD

Médica egresada de la Universidad de La Sabana, especialista en Microbiología Médica de la Pontificia Universidad Javeriana, especialista en Bioética de la Universidad de La Sabana, MSc en Ciencias Microbiológicas de la Universidad Nacional de Colombia. Actualmente estudiante de Doctorado en Ciencias Biológicas en la Universidad de los Andes. Durante sus estudios de doctorado propone la iniciativa One Health (Una salud), en la cual se considera que la salud humana y la salud animal son interdependientes y están vinculadas a los ecosistemas en los cuales coexisten.  Fusarium y Neocosmospora han sido descritos como patógenos de humanos, animales y plantas, un fenómeno conocido como patogenicidad trans-reino.  teniendo esto en cuenta y entendiendo la interfaz humano-animal-ambiente como un problema de salud pública, esta propuesta pretende resolver la pregunta: ¿Existe diferencias en la interacción huésped-patógeno, susceptibilidad antifúngica-fungicidas, mecanismo de resistencia y expresión de genes en aislamientos clínicos, hospitalarios, animales y ambientales de Fusarium?

Tesis: "Estudio de la patogenicidad y resistencia a antifúngicos/fungicidas en Fusarium: Una aproximación desde la iniciativa One Health"

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researchgate: Valeri Saenz

Google Académico: Valeri Andrea Sáenz Moncaleano

Líneas de investigación:

  • Fusaroides
  • Resistencia antimicrobiana

Estudiantes de maestría

Andrés Felipe Lizcano Salas M.Sc

Andrés es microbiólogo egresado de la Universidad de los Andes. Actualmente estudiante de maestría Ciencias Biológicas área microbiología y maestría en biología computacional en la Universidad de los Andes. Durante sus estudios de maestría en Ciencias Biológicas, Andrés intentará resolver algunos nodos problemáticos dentro del árbol filogenético del clado Terminal Fusarium (TFC) con un enfoque filogenómico. Este proyecto se esta llevando a cabo en colaboración con el profesor Jorge Duitama de la Universidad de los Andes. Asimismo, durante el desarrollo de su maestría en biología computacional se encuentra desarrollando un proyecto de secuenciación de genomas de aislamientos clínicos de Neocosmospora. En el cual busca identificar y comparar transposones en diferentes especies de relevancia clínica.

Proyecto maestría en biología computacional 2023: "Transposable element-rich regions in Neocosmospora clinical isolates"

Tesis maestría ciencias biológicas 2023: "Fixing the tree: a philogenomic approach reveals a robust time scale of the Terminal Fusairum Clade"

Tesis pregrado 2020: Mutación R30Q en CYP51A de Neocosmospora solani asociada a resistencia a azoles

Felipe Mora Restrepo M.Sc.

Felipe es biólogo egresado de la Universidad Nacional de Colombia. Durante sus estudios de Maestría en Ciencias Biológicas de la Universidad de los Andes evaluo el papel de lípidos exógenos representativos del sebo humano, como lo es el colesterol, escualeno, ácido esteárico y ácido oleico; en un modelo de infección de M. furfur, M. restricta, y M. sympodialis con queratinocitos de la línea celular HEKa. Este proyecto se llevo a cabo en colaboración con el Dr. John Mario González de la Facultad de Medicina.

Tesis 2022: Estudio del efecto de lípidos exógenos en modelos de infección de queratinocitos con tres especies de Malassezia

Reconocimiento: Mejor tesis de maestría 2022-2

Angie Paola Sastoque M.Sc

Angie es licenciada en Biología egresada de la Universidad Distrital Francisco José de Caldas, MSc en Ciencias Microbiológicas de la Universidad Nacional de Colombia. Durante su maestría adelantó estudios en la evaluación del impacto de las enzimas homoserina deshidrogenasa (HSD), homocitrato sintasa (HCS) y sacaropina deshidrogenasa (SDH), propuestas previamente como objetivos terapéuticos a partir de la reconstrucción basada en restricciones (COBRA) de este organismo, sobre el crecimiento de M. pachydermatis, inhibiéndolas con los aminoácidos producto de las vías metabólicas en las que participan. Para lograrlo, se realizaron ensayos de actividad enzimática por métodos colorimétricos, así como pruebas de sensibilidad in vitro mediante microdilución y difusión en agar con pozo probando concentraciones de L-lisina. Lo anterior en colaboración con el grupo de diseño de productos y procesos (GDPP), Departamento de ingeniería química, Universidad de los Andes.

Tesis 2019: Evaluación de la actividad enzimática de candidatos como objetivos terapéuticos para el tratamiento de infecciones asociadas con Malassezia pachydermatis

Juan Sebastián Molina Pineda M.Sc

Juan Sebastian es microbiólogo de la Universidad de los Andes. Durante sus estudios de Maestría en Ciencias Biológicas con énfasis en Microbiología en la Universidad de los Andes evaluo la capacidad antifúngica de tres péptidos antimicrobianos (cecropinas) contra levaduras de importancia clínica del genero Malassezia.

Tesis 2023: Evalución de Satanin-1 como candidato antifúngico contra Malassezia

Kevin Ehemann Guerrero M.Sc.

Kevin es Microbiólogo e Ingeniero Biomédico egresado de la Universidad de los Andes. Actualmente se encuentra en programa de maestría en ciencias biológicas en la universidad de los Andes. En su proyecto de grado trabajo con el género Malassezia en la búsqueda de candidatos terapeúticos. Previamente, en el grupo de investigación se determinó la capacidad que posee la lisina de inhibir el crecimiento de esta levadura, por lo que este proyecto tuvo como fin el trasladar estos hallazgos a una aplicación clínica en forma de una crema o emulsión basada en lisina que tenga la capacidad de inhibir el crecimiento de esta levadura, y de dicha forma, tratar las enfermedades asociadas a Malassezia. Para esto, primero se formulo y se desarrollo una emulsión basada en lisina con las propiedades físicas y biológicas que aseguren su estabilidad en el tiempo, capacidad inhibitoria y baja o nula toxicidad para las células humanas.

Tesis maestría 2022: "An alternative approach for Malassezia associated skin diseases treatments: a lysine-based emulsion"

Tesis pregrado 2019: Evaluación de inhibidores candidatos del crecimiento de Malassezia

María Juliana Mantilla M.Sc.

Maria Juliana es microbióloga Industrial egresada de la Pontificia Universidad Javeriana, MSc en Ciencias Biológicas área Microbiología de la Universidad de los Andes. Durante sus estudios de maestría en la universidad de los Andes adelantó experimentos de lipidómica de levaduras de Malassezia pachydermatis e implementó una técnica para la extracción de los lipid droplets de estas levaduras.  Estos trabajos se han realizado en colaboración con la universidad de Utrecht, Holanda, donde Maria Juliana llevó a cabo una pasantía de investigación

Tesis 2020: "Malassezia pachydermatis CBS 1879 Lipid droplets (LD): an approach for the characterization of the structure and composition"

Reconocimiento: Mejor tesis de maestría 2020-1


Estudiantes de pregrado

Maria Camila Castaño Aguirre

Monografía 2022: Los lípidos y la conexión con virulencia en hongos patógenos de humanos

Reconocimiento: mejor trabajo de grado - microbiología 2022-2

Andrés Guillermo Contreras Carreño

Tesis 2021: Susceptibilidad a antifúngicos en especies de Malassezia spp. por microdilución en placa y E TEST® relacionadas con entidades clínicas

Linamarcela Beltrán Moya

Tesis 2021: Evaluación del efecto de una emulsión de perfluoro-octilo bromuro en el crecimiento in vitro de Klebsiella pneumoniae

Reconocimiento: segunda mejor tesis de microbiología 2021-1

Luis Jaime González Fajardo

Tesis 2021: Aislamiento de Fusarium de suelos y sistemas de distribución de agua en un cultivo de clavel en la sabana de Bogotá D.C

Alejandra Rodríguez Pacheco

Monografía 2020: Interacciones entre organismos mediadas por compuestos orgánicos volátiles (COVs) producidos por bacterias y hongos

María Paula Naranjo

Monografía 2020: Aproximación a la caracterización de Lipid Droplets en levaduras, a nivel de morfología y composición

Carolina Puentes Soto

Tesis 2019: Genotipificación de especies atípicas de Malassezia y Malassezia spp.

Gabriela Ariza

Tesis 2019: Caracterización morfológica de Lipid droplets (LDs) en Malassezia spp. mediante microscopía confocal de barrido láser

Reconocimiento: Mejor tesis de pregrado 2019-1

Luna Camila González Duarte

Tesis 2019: Evaluación de la actividad inhibidora de los péptidos antimicrobianos Buforina II y Frenatin 2.3S ante diferentes especies de Malassezia mediante ensayo de microdilución en placa

Fredy Leonardo Carreño

Proyecto de investigación 2019: Evaluación del efecto de perfluoro-octil bromuro emulsificado sobre el crecimiento in vitro de Pseudomonas aeruginosa resistente a gentamicina.

Martha Liliana González

Tesis 2021: Evaluación cuantitativa de la dinámica en el tiempo de los lipid droplets en cinco especies de Malassezia

Juliana Diaz Ortiz

Tesis 2021: Galleria mellonella como modelo de piel in vivo para evaluar compuestos antifúngicos tópicos

María Fernanda Lozano Vivas

Tesis 2021: Efecto de tres potencias de láser oftálmico de 532nm sobre el crecimiento de Fusarium-like in-vitro.

Jairo Alejandro Gaitan Alfonso

Proyecto de investigación 2021: Evaluación del efecto de una emulsión de Perfluoro-octilo Bromuro sobre el crecimiento in vitro de Staphylococcus aureus

Marcelo Consuegra Asprilla

Monografía 2020: Sensibilidad antifúngica en levaduras del género Malassezia spp. ¿Qué sabemos acerca de este tema?

Max Isaac Sarmiento Boada

Monografía 2020: "Malassezia: Virulencia e Inmunología"

David Felipe Soto

Tesis 2019: Estandarización de un protocolo de infección de Malassezia furfur CBS 1878 para la evaluación de tropismo en larvas de pez cebra (Danio rerio)

Flor María Rey

Tesis 2019: Galleria mellonella como modelo de estudio de Malassezia pachydermatis CBS 1879

Elkin Nicolas Pinzón Pineda

Tesis 2019: Galleria mellonella como un novedoso modelo de estudio de Malassezia furfur CBS 1878

Yinneth Marcela Gutierrez

Tesis 2019: Identificación de especies de Fusarium-Like mediante MALDI-TOF para actualización de bases de datos.


Investigadores

Heydys Paola Martínez pedrozo B.Sc.

Heydys es microbióloga egresada de la Universidad Popular del Cesar. Como joven investigador en el laboratorio CeMoP se vinculó en diferentes proyectos: 1) evaluación de potenciales inhibidores de crecimiento de Malassezia spp.,  2) evaluación de la inhibición del crecimiento in vitro de Pseudomonas aeruginosa resistente a aminoglucósidos en presencia de perfluoro-octil bromuro, 3) aproximación al micobioma de Phyllomedusa sp., 4) implementación de larvas de Galleria mellonella como modelo de infección novedoso para Malassezia, 5) estudio de susceptibilidad in vitro a péptidos derivados de Crotalicidina y Catelicidina como agentes antimicrobianos para Staphylococcus aureus MRSA y MSSA. Asimismo, apoyo en la organización de protocolos y asistencia a clase.